jnmedsys 数字PCR

数字PCR是可以实现分子绝对定量的仪器，和PCR技术、荧光定量PCR（qPCR）技术相比，具有绝对定量优势，和高通量测序（NGS）相比，又具有较高的灵活性，兼具成本把控优势。JN Medsys的数字PCR（Clarity TM）是一种新型的数字PCR，可实现分子的绝对定量。不同于微滴式数字PCR，该仪器采用了8联管管内芯片设计，分区更稳定，无需移液步骤，数据更准确。每个上样管内部的高密度芯片拥有10000个分区，拥有高灵敏。具有独特优势：8联管兼容市面上的普通PCR仪和试剂，降低实验成本；采用了封闭式系统，减小了污染；全自动分区，利用表面张力、虹吸原理上样，分区速度小于1分钟；分析速度在同类仪器中突出，96个反应时间仅为4小时。十分适合低丰度分子的高灵敏度、绝对定量分析。

8联管管内芯片设计专利技术

检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量，从而提供了比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究，尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况，比如等位基因的不平衡表达以及单细胞基因表达分析等；

2. 其他基因组学及表观遗传学相关研究

①拷贝数变异(CNV)研究：

通过8连管内芯片上上万个分区对样本进行处理及后续扩增，摆脱Ct值的计算方法而直接获取目标基因的绝对拷贝数，为拷贝数变异的研究提供了绝对的检测精度。还可进行NGS文库定量，成本低、通量高。

②稀有突变检测：

对于稀有突变检测，定量PCR、及NGS等方法都因受到背景DNA的干扰，使得检测灵敏度及精确性都达不到精细定量的要求(如定量PCR检测中Ct值大于33的情况下，其重复性就不是很高)， 而JNMedsys ClarityTM Digital PCR通过对样本的上万个分区处理，使得稀有突变从大量的背景DNA中分离出来，从而提高了检测的灵敏度及重复性。

3. 医学分子检测

①精准医疗（转化医学）的应用：

如肺癌等相关的EGFR、KARS、BRAF基因的SNP突变检测、乳腺癌的HER2基因检测等从而指导各种靶向药物的选择与用药方案的调整。

②疾病超早期分子检测：

随着研究的展开，很多实验室发现基于ddPCR对于诸如血液、痰液、尿液等体液样品中核酸水平的疾病相关标记分子（DNA、mtDNA、miRNA等）的检测，其发现疾病的时间远早于影像学或其他蛋白类标记物的相关检测，而且结果的灵敏度更高，稳定性更好，与传统的核酸检测方法相比，大大提前了疾病发现的窗口期，更好地实现对疾病的早发现，早治疗。

4. 病原微生物的检测（病毒、细菌等）

疾病预防控制中心、出入境检验检疫局系统的实验室目前主要采用基于TaqMan探针法的定量PCR体系对病原微生物进行核酸水平的检测，而这些目前正在使用着的检测体系可以无缝地转移到JNMedsys ClarityTM Digital PCR上，从而满足该类实验室对于检测结果的要求：灵敏度更高、重复性更好、无需依赖标准曲线的绝对定量结果，同时操作简便。

5. 转基因食品或成分的检测

目前在确定转基因作物或成分的含量时采取定量PCR的标准曲线法，这种方法需要依赖于已知浓度的标准品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。JNMedsys ClarityTM Digital PCR绝对定量的方式可以彻底解决这些标准物质的定标工作。

配置参数：

Clarity™ Auto Loader (自动上样仪)：1 set

自动上样仪(Clarity™ Auto Loader)，将PCR反应液上样到8联管内的高密度微孔芯片中，能将反应液自动分成1万个纳升级的等分区域。PCR反应液体积仅需15ul

*分区稳定，各区间无融合或相互干扰。

*可同时上样8个样品，分区时间少于1分钟，96个样本少于10分钟

*上样后的操作均在8联管内进行，无液体转移步骤，可降低样品损失，避免交叉污染

* 电源条件：100~240V

Clarity™ Sealing Enhancer（封闭优化仪）：1 set

封闭优化仪(Clarity™ Sealing Enhancer)利用气压平衡原理，自动将微孔道分区内PCR反应液位置居中，然后加入封闭液，将样本封闭在芯片分区中。仪器可直接开机使用，无需预热，无需封闭程序调节

封闭液封闭后的8联管可直接进行PCR扩增反应。

Clarity™ Reader（数据读取仪）：1 set

数据读取仪(Clarity™ Reader)PCR扩增后产物通过数据读取仪进行结果检测

*每次可上样32个样本采用CMOS读取PCR反应后芯片微孔分区内的荧光信号以LED作为检测光源

*信号读取快速，45分钟内可完成96个样品的数据读取。具有双重荧光检测通道，支持双重基因检测。可检测FAM & VIC/HEX荧光探针，也可兼容EvaGreen和SYBR Green染料。

*完全封闭的检测模式，可有效避免交叉污染。

分析软件：1 set

*可通过计算机连接并控制数据读取仪，进行荧光信号影像采集。

*通过荧光影像数字化分析结果，软件利用“泊松分布”演算法计算样本靶目标的分子拷贝数与样本原始浓度。

*可对多个样品的平均值和总误差进行统计分析。

*软件对双探针分析的结果可以给出散点图。

*结果可直接打印，或以Excel表格形式输出。

Clarity Consumables Package (96 reactions)（耗材）：1 set

includes: 

1. Clarity sealing fluid, 30ml 

   Clarity 分区封闭液，30毫升

2. Clarity Tube-strip, set of 12 

    Clarity 芯片式8连管，12组

3. Calrity sample laodingkit, set of 12

    Clarity 上样套装，12套

JN Solution, 96 reaction：1 set